Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Impg1Q8R1W8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Impg1Q8R1W8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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