Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxc12Q8K5B8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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