Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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SbsnQ8CIT9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SbsnQ8CIT9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms