Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CcinQ8CDE2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CcinQ8CDE2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CcinQ8CDE2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CcinQ8CDE2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CcinQ8CDE2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcinQ8CDE2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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