Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp37Q8C0R0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms