Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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