Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rufy1Q8BIJ7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms