Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf139Q7TMV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms