Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ScocQ78YZ6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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