Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Trappc6aQ78XR0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6aQ78XR0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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