Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc44a1Q6X893 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc44a1Q6X893 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms