Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad54bQ6PFE3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms