Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bend3Q6PAL0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms