Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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