Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcncQ62447 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CcncQ62447 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms