Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Six3Q62233 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Six3Q62233 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Six3Q62233 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Six3Q62233 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Six3Q62233 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Six3Q62233 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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