Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Six1Q62231 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms