Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sin3bQ62141 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms