Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itga6Q61739 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms