Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dsg1aQ61495 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dsg1aQ61495 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms