Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamb3Q61087 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms