Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sim2Q61079 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms