Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp17laQ61068 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms