Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms