Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3Q60803 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Traf3Q60803 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms