Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ItgaeQ60677 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms