Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5935Q497S0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms