Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc114Q3UX62 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms