Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm29609Q3UU56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms