Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm5460Q3UQ97 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5460Q3UQ97 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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