Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp3Q3ULW8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms