Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm648Q3UJ22 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms