Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdhd2Q3UGR5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd2Q3UGR5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms