Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U1D9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U1D9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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