Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Fam107bQ3TGF2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam107bQ3TGF2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms