Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbtb38Q3LR78 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms