Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cpne9Q1RLL3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cpne9Q1RLL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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