Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rpusd3Q14AI6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd3Q14AI6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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