Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klrb1Q0ZUP1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klrb1Q0ZUP1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms