Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps8Q0P5W1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms