Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubxn2bQ0KL01 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubxn2bQ0KL01 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms