Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gata4Q08369 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms