Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cntn3Q07409 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms