Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc2Q05020 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoc2Q05020 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms