Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox13Q04891 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms