Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx2Q03358 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms