Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gja5Q01231 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms