Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx3P81067 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms