Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irx2P81066 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx2P81066 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms