Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Otx2P80206 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Otx2P80206 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Otx2P80206 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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